PESTICIDES : Ils tuent aussi nos bonnes bactéries
Les pesticides et autres polluants chimiques courants sont toxiques pour notre flore intestinale ou microbiote bénéfique, conclut cette équipe de biologistes de l’Université de Cambridge. L’étude, publiée dans la revue Nature Microbiology, appelle à évaluer la sécurité des nouvelles substances chimiques destinées à l'usage humain et de garantir leur innocuité aussi pour notre microbiote intestinal.
Parmi les substances chimiques toxiques pour la flore intestinale humaine figurent les pesticides, tels que les herbicides et les insecticides, pulvérisés sur les cultures. Jusque-là, la plupart de ces substances chimiques, susceptibles de pénétrer dans notre organisme par l'alimentation, l'eau et l'exposition à l'environnement, étaient considérées comme inoffensives pour les bactéries. Cette nouvelle recherche montre que ces substances chimiques inhibent la croissance des bactéries intestinales considérées comme essentielles à la santé.
Le microbiote intestinal humain est composé d'environ 4.500 types de bactéries différents, qui contribuent tous au bon fonctionnement de notre organisme. Un déséquilibre du microbiote peut avoir des répercussions importantes sur notre santé, notamment des troubles digestifs, l'obésité, et affecter notre système immunitaire et notre santé mentale. Les évaluations standard de sécurité chimique ne prennent pas en compte le microbiome intestinal humain, car ces produits chimiques sont formulés pour agir sur des cibles spécifiques ; par exemple, les insecticides ciblent les insectes (et non le microbiote…).
L’étude a consisté à cribler en laboratoire à grande échelle 1.076 substances chimiques de synthèse, exposées à 22 espèces de bactéries intestinales, à l’aide d’un modèle d’apprentissage automatique capable de prédire si des produits chimiques industriels – qu’ils soient déjà utilisés ou en développement – seraient nocifs pour les bactéries intestinales humaines. Cette méthodologie leur a permis d'identifier 168 substances toxiques pour les bactéries présentes dans l'intestin humain en bonne santé. L’analyse révèle ainsi que :
- un grand nombre de ces substances chimiques inhibent la croissance des bactéries intestinales considérées comme essentielles à la santé ;
- les bactéries, en modifiant leur fonctionnement pour tenter de résister aux polluants chimiques, deviennent pour certaines résistantes à des antibiotiques comme la ciprofloxacine ;
- si ce phénomène venait à se produire dans l'intestin humain, ce qui semble probable, les infections pourraient devenir plus difficiles à traiter.
- parmi les substances chimiques toxiques pour les bactéries intestinales figurent les pesticides tels que les herbicides et les insecticides pulvérisés sur les cultures mais aussi les produits chimiques industriels utilisés dans les retardateurs de flamme et les plastiques.
« Nous constatons ainsi que de nombreux produits chimiques conçus pour agir uniquement sur un type de cible, par exemple les insectes ou les champignons, affectent également les bactéries intestinales. Nous avons été surpris de constater que certains de ces produits chimiques ont des effets extrêmement marqués ».
Ces premières données constituent une étape pour prédire les effets de nouvelles substances chimiques, sur notre santé.
« L'évaluation de la sécurité des nouvelles substances chimiques destinées à l'usage humain doit garantir leur innocuité pour notre microbiote intestinal, qui peut y être exposé via notre alimentation et notre eau ».
Source: Nature Microbiology 26 Nov, 2025 DOI: 10.1038/s41564-025-02182-6 Industrial and agricultural chemicals exhibit antimicrobial activity against human gut bacteria in vitro
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Cette actualité a été publiée le 15/04/2026 par
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